克日 ，南方医科大学南方医院、南方医科大学南方医院增城院区呼吸与危重症医学科团队团结333体育官网完成的研究效果 ，揭晓于国际期刊《Frontiers in Microbiology》（JCR Q1）。
该研究系统较量了社区获得性肺炎（CAP）与重症肺炎（SP）在临床特征、病原谱及下呼吸道微生物群落方面的差别。
论文宣布截图
研究配景
社区获得性肺炎（CAP）和重症肺炎（SP）是临床常见的呼吸系统疾病 ，严重威胁人类康健。CAP患者多为中轻度病情 ，而SP患者则往往陪同高炎症反应、病原重大、预后不良等情形。探索两类肺炎在临床体现与病原学层面的差别 ，关于精准诊断和个体化治疗具有主要意义。
研究设计
本研究纳入243例肺炎患者的肺泡灌洗液样本。研究团队基于宏基因组二代测序（mNGS）手艺举行回首性剖析 ，系统较量CAP与SP在临床特征、炎症指标、病原组成及微生物群落等方面的差别 ，旨在为肺炎的分型诊断与精准治疗提供新依据。
研究效果
1 微生物谱差别显著
mNGS剖析显示 ，CAP与SP患者的微生物谱保存显著差别（图1）。研究通过维恩图展示了两组间微生物种类的重叠情形 ，并进一步展现了病毒、真菌和细菌等种种微生物在差别肺炎类型中的检出差别。效果提醒 ，差别类型肺炎的微生物漫衍模式具有显着区别 ，为疾病精准分型提供了新的视角。
图1 CAP和SP组微生物的漫衍判断
2 重症肺炎微生物异质性更高
研究通过Shannon、Simpson、Richness和Chao1等多样性指标的箱线图 ，直观展示了CAP与SP之间的差别（图2）。效果显示 ，两类肺炎患者在整体多样性水平上并无显着差别。进一步的PCA与PCoA剖析（基于mNGS数据）批注 ，CAP与SP微生物组结构保存显著差别（p=0.001） ，CAP组样本更细密 ，群落结构相对一致。SP组样天职散度更高 ，群落越发异质。CAP与SP患者的微生物组“外貌多样性”相似 ，但“内部结构”却显著差别 ，这或许正是影响病情希望的要害。
图2 CAP和SP患者之间微生物组多样性和组成的较量
3 生物标记物新突破
研究团队使用LEfSe剖析与ANCOM-BC2要领 ，识别出CAP与SP在微生物分类学上的显著差别。其中 ，铜绿假单胞菌（Pseudomonas）和念珠菌（Candida）与SP的关联性最为突出。同时 ，维恩图显示 ，念珠菌、铜绿假单胞菌、流感嗜血杆菌和链球菌这四种分类群在两种剖析要领中均被识别 ，进一步证实了其作为潜在生物标记物的可靠性（图3）。这些发明为早期诊断和干预提供了主要线索。
图3 通过双重剖析要领确定的CAP组和SP组之间的微生物分类学差别
研究小结
本研究基于mNGS的系统剖析批注：CAP与SP在临床特征、病原组成、共熏染模式及微生物群落结构方面均保存显著差别。
作为一种快速、无偏的检测手艺 ，mNGS在分层诊断与指导精准抗熏染治疗方面展现出重大应用潜力 ，可资助临床医生更高效、准确地识别病原体 ，从而优化治疗计划 ，推动肺炎诊疗迈入精准医学新阶段。
展望未来 ，基于多中心、大样本的mNGS研究将有望进一步完善肺炎分型诊断系统 ，并推动更多病原学标记物的发明 ，为重症熏染患者的早期识别与救治提供更有力的支持。
